步进电机的起动频率不能过高，这是因为步进电机刚起动时转速为零，在起动过程中，电磁转矩除了克服负载阻转矩外，还在克服转动部分的惯性掩蔽，所以起动时电机的负担比连续运转为重。
如果起动时脉冲频率过高，则转子的速度就跟不上定子磁场旋转的速度，以致第一步完了的位置落后于平衡位置较远，以后各步中转子速度增加不多，而定子磁场仍然以正比于脉冲频率的速度向前转动，因此转子与平衡位置之间的距离越来越大，最后因转子位置落到动稳定区以外而出现失步或是振荡现象，因而使电机不能起动。
各种步进电机的启动频率各不相同，需要按照电机的说明数据确定启动频率，许多高启动频率的电机使用双电压操作即启动瞬间由高压变化为低压，而且步距越小越适合高频率启动，功率越大越适合高频率操作。
为了能正常起动，起动频率不能过高，当电机起动后再逐步升高频率。
